隨著時間推延，中印關係出現了變數，其中之一便是韓戰後，中國受到以美國為首的西方陣營制裁，在外交上十分孤立，中印建立友好關係，並未能為印度帶來預期抗衡歐洲，或抗衡歐美的效果。另一方面， 毛澤東 在中國推行激進的社會主義化政策，接連不斷的政治運動，令印度政府有所疑慮。尼赫魯原先設想引導 共產主義 中國成為亞洲和平堡壘的意圖沒法實現。中國推行 大躍進 後，印度政府不再將中國視為友好國家。於是，一些在友好國家之間能諒解、容忍的爭議性問題逐步浮現，而且有可能演變成為兩國之間的矛盾，甚至發展為國際衝突。而最核心、最具爭議性的問題就是西藏問題，以及源於西藏問題的中印邊界爭議。

西藏問題和中印邊界爭議，都是英國統治印度時期所遺留的歷史問題。英國統治印度期間，印英殖民地當局對西藏虎視眈眈，曾經出兵入侵西藏，但是由於西藏地理環境惡劣，英軍後援不繼，不得不撤退。其後，英印當局以通商、考察、文化交流等理由，不斷派人進入西藏，遊說西藏上層喇嘛及部分地方部族首領接受英國資助，蘊釀西藏和清朝脫離從屬關係。由於清朝對西藏的管治並不嚴密，而且清朝國勢日漸衰落，西藏的親英勢力不斷擴大。但是由於宗教和文化關係，西藏各地、各界的親中力量仍然強大。