「海基」、「海協」兩會成立，為兩岸會談創造條件。不過，雙方經常在事務性問題上，因為國家定位問題而出現僵局，變成政治角力。同時，台灣島內的統獨爭議日漸尖銳化，兩岸之間的矛盾未能化解。有學者認為，90年代初，兩岸試圖求同存異，嘗試找尋出雙方可以接受的方案。1992年7月31日，李登輝簽署並且公布「兩岸人民關係條例」，將海峽兩岸交流納入法制之中，無可避免，涉及「中國」的定義：8月1日，「國統會」通過「一個中國」的涵義，海峽兩岸同屬一個中國，但雙方賦與的涵義有所不同，中共當局認為一個中國即「中華人民共和國」，台灣當局則認為一個中國所指是1911年成立至今的中華民國，其主權涵蓋整個中國，但目前治權只包括台灣、澎湖、金門、馬祖。台灣固然屬於中國的一部分，但大陸亦屬於中國一部分，民國38年起，中國處於暫時分裂狀態，由兩個政治實體分治兩岸，任何統一主張不能忽視此一事實。