清朝光緒10年，即是公元1884年，欽差大臣左宗棠在平定新疆地區的叛亂之後，奏請清朝朝廷設立新疆省。自此之後，新疆地區實行與內地相同的地方行政制度。新疆省的行政中心，由伊犁遷移到迪化，即是烏魯木齊。1911年辛亥革命之後，直至1944年，新疆省先後由3個軍閥統治，這三個軍閥分別是1912年到1928年統治新疆的楊增新，1928年到1932年統治新疆的金樹仁，以及1932年到1944年統治新疆的盛世才。在這30多年的軍閥統治期間，中央政府亦處於軍閥割據混戰、日本侵略時期，對於偏遠的新疆省，實在鞭長莫及。統治新疆省的軍閥，名義上擁護中央，實際上進行獨裁統治，由於新疆鄰近蘇聯，因此蘇聯政府對新疆的軍閥政權，發揮相當重要的影響力。最後一任軍閥盛世才，是遼寧省開原縣人，年青時候加入奉系軍隊，被保送到日本軍校學習。畢業之後回國，自願前往新疆軍隊任職。1932年，新疆政局動盪，盛世才發揮軍事才幹，穩定局面，於是建立軍中威望。
1933年4月，新疆發生軍事政變，原有的軍閥金樹仁被推翻，盛世才乘機控制大局，並且拘留國民政府特使，迫使中央任命他為新疆省政府主席。其後，盛世才借助蘇聯的力量，擊敗各方面的反對勢力，開始建立獨裁政權。盛世才掌握軍政大權之後，推行所謂6大政策：即是「反帝、和平、建設、民族平等、清廉、親蘇」，鼓吹民族平等、宗教自由、澄清吏治、改良司法、擴充教育、整頓財政，推行自治等施政方針，一時間令新疆的政治面目一新。由於盛世才的親蘇政策，他不但容許中共在新疆設立辦事處，而且邀請中共黨員參加新疆省政府的工作，陳潭秋、毛澤民等人成為新疆省府高級官員。盛世才為了鞏固權力，以殘暴手段鎮壓異己，新疆的政局亦因此潛伏危機。
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